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    ChIA-PET 该技术将 HiC 与 ChIP-seq 结合，可以检测目的蛋白质的所有互相作用 四、总结 参考 [1]: de Wit E, de Laat W (January 2012) "A decade of 3C technologies: insights into nuclear organization" [2]: Naumova N, Smith EM, Zhan Y, Dekker J (November 2012)
  • Hi-C（染色质构象捕捉技术）_百度百科
    Lieberman-Aiden等发现，哺乳动物HiC试验的分辨率为~1Mb (~10 RMPD，million paired-end reads)。 通过4C确定试验在Hi-C可以得到验证。 Hi-C试验让科学家们发现，核内存在特定的染色质区隔（Chromatin Compartment），染色质和异染色质在不同的区域（Open区和Close区）。
  • Hi-C分析练习（从fastq文件到contact矩阵） - 简书
    本篇笔记按照哈佛医学院贴在网上的教程走一遍流程，虽然这个教程是2018年的，但我觉得仍然很有参考价值。 具体可参考网址： https: github com hms-dbmi hic-data-analysis-bootcamp （一）下载练习文件 根据教程，你需要先下载练习用的fastq文件和相关基因组索引文件：
  • HiC测序_hi-c测序-CSDN博客
    2 矩阵生成 使用工具如 HiCExplorer 将比对数据转换为接触矩阵： # 生成接触矩阵 hicBuildMatrix --samFiles filtered bam \ --binSize 10000 \ --restrictionSequence GATC \ --outFileName hic_matrix h5 一键获取完整项目代码
  • HIC | HIC | an archive of architectures and other things
    HIC is an archive of architectures and other things Sort by Academic, Things, Classic, Books Josep Lluis Sert Sert House Luigi Caccia Dominioni Via Massena Gottfried Böhm Chorweiler Social Housing
  • Hi-C辅助基因组组装 | 百迈客生物 - BioMarker
    文章中使用的技术手段包括BAC+Illumina+BioNano+HiC+Genetic Map，得到了4 79 Gb基因组序列，最终利用HIC和遗传图分别将95%和97%的序列挂到了染色体的水平。 相比于初版基因组，组装水平高了不只是一大截啊，这就是技术上的胜利！
  • GitHub - deeptools HiCExplorer: HiCExplorer is a powerful and easy to . . .
    About HiCExplorer is a powerful and easy to use set of tools to process, normalize and visualize Hi-C data hicexplorer readthedocs org python bioinformatics genomics galaxy hic chromosome-conformation-capture Readme GPL-3 0 license Contributing
  • Hi-C (genomic analysis technique) - Wikipedia
    Several variations of read mapping techniques are implemented in many bioinformatics pipelines, such as ICE, [36] HiC-Pro, [37] HIPPIE, [38] HiCUP, [39] and TADbit, [40] to map two portions of a paired end read separately, in the case that the two portions match distinct genomic positions, thus addressing the challenge where reads span the
  • Home Improvement Contractor Program - Mass. gov
    The Office of Consumer Affairs and Business Regulation (OCABR) oversees the Home Improvement Contractor (HIC) program that helps protect consumers and regulate the business practices of contractors
  • Genome-Wide HiC – Arima Genomics
    “The ability of Arima-HiC kits to deliver greater insight with less sequencing cost will be critical in enabling more researchers to leverage Hi-C technology for understanding gene regulation within the three-dimensional context of the genome ”





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